¿Qué son los modelos moleculares?
Los modelos moleulares se utilizan ampliamente para comprender cómo interactúa una molécula con otra y como estas interacciones pueden afectar a la salud humana, el medio ambiente e incluso las tecnologías emergentes. Las herramientas demodelado molecular son esenciales en muchas industrias diferentes incluyendo farmacología , química sintética, biotecnológia y materiales avanzados .
En este artículo se discuten 10 herramientas populares para el modelamiento moleculare:
###. VMD (Visual Molecular Dynamics) – Es un software gratuito que permite a los usuarios visualizar estructuras y simular dinámica de molécula en tres dimensiones . Este programa es ampliamente utilizado por investigadores para estudiar la estructura, el movimiento , las interacciones moleculares y otros aspectos relacionados con la química.
2. GROMACS – Es un paquete de software que se utiliza comúnmente en biología estructural e ingeniería biofísica para simular sistemas macromoleculares complejos, como proteínas , ácidos nucleicos y lipídos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estrutura y el comportamiento molecular.
3. NAMD – Es un software libre que se utiliza para simular sistemas biológicos complejos, como proteínas , ácidos nucleicos e lipídos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estructura y el comportamiento molecular.
4. CHARMM – Es un paquete de software que se utiliza comúnmente en química computacional para simular sistemas macromoleculares complejos, como proteínas , ácidos nucleicos e lipídos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estructura y el comportamiento molecular.
5. GAMESS – Es un paquete de software que se utiliza comúnmente en química computacional para simular sistemas macromoleculares complejos, como proteínas , ácidos nucleicos e lipídos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estructura y el comportamiento molecular.
6. Gaussian – Es un software comercial que se utiliza comúnmente en química computacional para simular sistemas macromoleculares complejos, como proteínas , ácidos nucleicos e lipídos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estructura y el comportamiento molecular.
7. Q-Chem – Es un software comercial que se utiliza comúnmente en química computacional para simular sistemas macromoleculares complejos, como proteínas , ácidos nucleicos e lipídos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estructura y el comportamiento molecular.
8. ORCA – Es un software libre que se utiliza comúnmente en química computacional para simular sistemas macromoleculares complejos, como proteínas , ácidos nucleicos e lipídos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estructura y el comportamiento molecular.
9. NWChem – Es un software libre que se utiliza comúnmente en química computacional para simular sistemas macromoleculares complejos, como proteínas , ácidos nucleicos e lipídos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estructura y el comportamiento molecular.
10. Amber – Es un software comercial que se utiliza comúnmente en biología estructural, bioquímica , química computacional e ingenieríabiofísica para simular sistemas macromoleculares complejos como proteínas y ácidos nucleicos . El programa es capaz de realizar una amplia gama de análisis sobre la estructura y el comportamiento molecular.
En resumen, hay muchas herramientas disponibles para los investigadores que trabajan en modelado moleculare , cada uno con sus propias ventajas e inconvenientes . Las decisiones finales acerca del cual software utilizar dependerán de la necesidad específica y el presupuesto disponible.